בעוד שבישראל מנסים לעצור את התפשטות המגיפה, צוות מיוחד שפועל תחת המל"ל מגבש תמונת מצב לנעשה ברשות הפלסטינית וברצועת עזה באמצעות מומחים ומודיעין צבאי. לפי גורם ביטחוני ששוחח עם מקור ראשון, ההנחה היא שהמספרים המדווחים באמצעות משרד הבריאות הפלסטיני אינם מתקרבים למציאות. זאת, הוא הסביר, מתוך הבנה שישנם חולים גם בעזה וגם ברש"פ, אך מנגד לא נעשים שם פעולות של ריחוק חברתי, ולכן, קצב ההדבקה שם עלול להגיע בכל רגע למספרים גדולים מאוד.
במערכת הביטחון עוקבים, נכון לעכשיו, בעיקר אחר הדיווחים שמגיעים לבתי החולים. אולם ההערכות הן שאיכות מערכת הבריאות יחד עם הצפיפות הגדולה – בעיקר ברצועה – עלולים להביא להתפרצות של המגפה במימדים שידרשו מישראל להגיש סיוע.

בחודש האחרון פועלת היחידה לתיאום פעולות הממשלה בשטחים בשיתוף פעולה מול הרשות הפלסטינית והקהילה הבינלאומית, במטרה לסייע במאבק נגד התפרצות נגיף הקורונה ביו"ש ובעזה. בין היתר, הועברו למערכות הבריאות הפלסטיניות, בתיאום מת"ק עזה והמנהל האזרחי ביו"ש, אלפי ערכות בדיקה לזיהוי הנגיף, כמו גם אלפי ערכות מיגון לשימוש הצוותים הרפואיים, וכן, חומרי חיטוי שונים.
בד בבד, תיאם המתפ"ש הדרכות רבות לצוותי רפואה שונים – הכוללים רופאים, אחיות, אנשי מעבדה ועוד – שהועברו על ידי רופאים ישראלים. כל זאת, לצד תיאום מעברן של עשרות משאיות שסיפקו ציוד רפואי, אשר נתרם על ידי ארגונים בינלאומיים שונים. "אם תהיה התפרצות של ממש, מה שהועבר עד היום לא מספיק לצורך התמודדות עם מגיפה שכזו. אנו מבינים שעלול להידרש סיוע גדול יותר ולזה אנו נערכים", הסביר הגורם הביטחוני.
מרגע התפרצות הנגיף בישראל ובשטחים שבשליטת הרשות הפלסטינית ועד לרגע זה – לא נסגרו מעברי הסחורות. מעבר כרם שלום פועל כשגרה, וכך גם שורה של מעברי סחורות שפועלים מג'נין ועד לחברון. במערכת הביטחון הדגישו כי גם מאות חולים פלסטינים נכנסים מדי יום מרצועת עזה ומשטחי יהודה ושומרון לקבלת טיפולים רפואיים מצילי חיים.
אחד המוקדים הראשונים להתפרצות המגיפה ברשות הפלסטינית היא העיר בית לחם. מיד עם היוודע הדבר, הטילה מערכת הביטחון סגר על העיר. לאחר מכן, עם העלייה בהיקף התושבים הפלסטינים המצויים בבידוד – החליטה הרשות הפלסטינית על הטלת סגר על כלל שטחי יהודה ושומרון. עם זאת, בצעד חריג ותקדימי, אישרה מדינת ישראל – בתיאום עם הרשות – לעשרות אלפי עובדים פלסטינים ללון בישראל לתקופה של חודשיים. ראוי לציין כי רק אתמול זכתה ישראל לקבל דברי שבח מגוף שבדרך כלל לא ממהר לעשות זאת – האו"ם. בין היתר, בזכות פעולות שנקט מתאם פעולות הממשלה בשטחים האלוף אבו רוקון, כדי שהפועלים העובדים בארץ לא יאבדו את מקום עבודתם בישראל ויוכלו להמשיך לפרנס את משפחותיהם חרף הסגר.
בימים אלה, כשישראל במרוץ מסביב לעולם להבאת ציוד רפואי, ציינו במערכת הביטחון כי חלק מהציוד שיגיע יועבר גם הוא לפלסטינים. בשלב הראשוני מדובר במסכות, כפפות וחומרי ניקוי, ובשלב הבא תרופות, ואם יצטרכו גם מכונות הנשמה. גורם במשרד הבריאות אישר כי רופאים ישראלים נמצאים בקשר יום יומי עם רופאים פלסטינים, גם עם בעזה, במטרה להעביר ידע שיכול להציל חיים.
מדוברות מתאם פעולות הממשלה בשטחים נמסר: "מדינת ישראל, באמצעות היחידה לתיאום פעולות הממשלה בשטחים תוסיף לפעול ולסייע למאבק נגד התפרצות נגיף הקורונה בשטחים הפלסטינים. זאת באמצעות הגשת סיוע, תיאום וקיום שיח ושיתוף פעולה מיטבי למול מערכת הבריאות הפלסטינית והקהילה הבינלאומית".