ביום רביעי שעבר, כשעלתה להצבעה במליאת הכנסת הצעת הליכוד להחלת הריבונות ביהודה ושמרון רצה ח"כ יום טוב כלפון מימינה להצביע בעד ההצעה, ביחד עם האופוזיציה, זאת בניגוד למשמעת הקואליציונית. אולם, כלפון סורב על ידי ראשי מפלגתו ונאלץ להצביע נגד, זאת בניגוד לצו מצפונו.
בשבת האחרונה, כשהתארח בביקור משפחתי אצל אחותו ביישוב כוכב יעקב, קיבל כלפון נזיפה פומבית בזמן התפילה מרב היישוב, אוריאל ספז, על הצבעתו. במוצאי השבת הסביר בהגינות את המורכבות הפרלמנטרית של הצבעתו, בשל היותו ח"כ במסגרת החוק הנורבגי. "אם הייתי מצביע בעד ריבונות – הייתי נענש וכנראה גם מאבד את המקום שלי בכנסת", כתב בצרפתית לתומכיו.
בעקבות האירוע, בוחן כלפון בימים האחרונים את האפשרות להגיש תלונה נגד רב היישוב, אוריאל ספז. בלשכתו של כלפון ערכו בירור משפטי ראשוני מול משרד הדתות, האם יש עילה להגיש נגד הרב תלונה.
הרב ספז לא דיבר על ריבונות באופן כללי, אלא ציין במדויק את ההצבעה של כלפון על החלת הריבונות, בנוכחות חבר הכנסת ובאמצע התפילה. מהבירור עולה כי לרב יישוב אין היתר להתעסק בנושאים פוליטיים כמו במקרה הנ"ל. נראה כי זהו מעשה שחורג מהנוהל המקובל והראוי, אך לא נוגע בתחום הפלילי. בעבר, כמו במקרה בו הרב שמואל אליהו הגן על השר לשעבר, הרב רפי פרץ, פסיקת בית המשפט העליון הורתה על כך שרב במשרה ציבורית לא יכול להיכנס לוויכוחים פוליטיים.
