המאמץ ללכוד את ששת המחבלים שנמלטו מכלא גלבוע נמשך, והוא מתבסס על ההנחה שברחו לשטחי הרשות הפלסטינית ולא לירדן. מקורות ברשות מדווחים על פעילות מוגברת של כוחות צה"ל בעיירות ובכפרים הסמוכים לגדר ההפרדה במחוז ג'נין. לפי המקורות הללו, יחידות סמויות וגלויות הוצבו בכפר ערקה מצפון־מערב לג'נין, בכפר יעבד ממערב לה ובכפרים אחרים החוצצים בין ג'נין לגדר ההפרדה.
הפלסטינים גם דיווחו על היתקלות בין כוחות הביטחון לפועלים פלסטינים שניסו לחצות באופן בלתי חוקי את גדר ההפרדה בין הכפר הפלסטיני רמאנה ממערב לג'נין לכפר הערבי־ישראלי סאלם שבעמק יזרעאל, ליד צומת מגידו. עשרה פועלים נעצרו לחקירה. לפי הפלסטינים, מאות חיילים הוצבו בשטח כדי למנוע חצייה בלתי חוקית של הגדר, ומצלמות אבטחה בכפרים הסמוכים לג'נין הוחרמו בניסיון למצוא מידע נוסף על מקום מחבואם של המחבלים הנמלטים.
במוצאי ראש השנה עצרו כוחות הביטחון הישראליים חמישה קרובי משפחה של שלושה מהמחבלים הנמלטים – בני משפחותיהם של מחמוד אל־עארדה, מנאדל נפיעאת ומחמד אל־עארדה. לפי הדיווחים המעצרים נערכו באזור ג'נין, במטרה להביא מידע חדש שיסייע ללכוד את הנמלטים.
"יש הרבה יחידות שפועלות באזור ג'נין, לטעמי ללא כל סיבה", אומר לנו מושל ג'נין, אכרם רג'וב. "המדיניות הישראלית פוגעת בתושבים באזור ג'נין, אבל לא תוביל למידע חדש אלא להגברת המתיחות. האסירים ברחו מכלא ישראלי, והאחריות כולה על הישראלים. אנחנו רואים פעילות לא אנושית של הצבא ושל השב"כ. הם מגיעים לבתים של קרובי משפחה של האסירים שברחו, ועוצרים אבות, אחים וקרובים אחרים ללא שום סיבה. בני המשפחות לא עזרו לאסירים לברוח. הם לא ביקרו אותם בכלא ולא הגישו להם עזרה. כל המעצרים באזור שלנו הם ענישה קולקטיבית לא חוקית".
לטענת רג'וב, מעצר בני המשפחה לא יוביל לפריצת דרך במציאות המחבלים הנמלטים. "אין למעצרים האלו משמעות. אני לא חושב שהאסירים ברחו לשטחי הרשות הפלסטינית, אני לא חושב שהם נמצאים אצלנו. הפגיעה במשפחות האסירים לא עומדת בקנה המידה של החוק הבינלאומי".
מושל ג'נין הזהיר מפני התלקחות אם אחד המחבלים ייתפס או ייפגע במהלך המצוד אחריהם. "יש חשש אמיתי לגורלם של האסירים. אם מישהו מהם ייפגע אני בטוח שיהיו לכך השלכות בשטח", איים. מקורות פלסטיניים אחרים העריכו שאם המחבלים הנמלטים נמצאים בשטחי הרשות והם יבקשו מקלט, מנגנוני הביטחון הפלסטיניים יעצרו אותם במעין מעצר מגן, ולא ימסרו אותם לידי ישראל.
בארגון חמאס מבקשים לגייס את ההימלטות לטובתם דרך התססת השטח, והודיעו על "יום זעם" נגד "יהירות הכיבוש ותוקפנותו כלפי האסירים" – כלומר, דיכוי ההתמרדות בבתי הכלא במהלך ראש השנה. בארגון הטרור קראו לפלסטינים באיו"ש להגיע למחסומים ולהתעמת עם ישראל, "לנוכח תוקפנות הכיבוש נגד האסירים, בעקבות תבוסתו וכישלונו לאחר הבריחה הגדולה מהכלא גלבוע", נאמר בהודעת חמאס. "אנשינו הגיבורים מוכנים להקריב קורבנות ולהילחם למען חירותם של האסירים… אנחנו קוראים להמוני עמנו מרפיח עד ג'נין להסלים את ההתנגדות ולהתעמת עם צבא האויב, במסר ברור למנהיגיו שאנחנו מאוחדים ונחושים להגן על אסירינו ועל מקומותינו הקדושים".
בארגון החזית העממית הצטרפו למאמץ ההסתה והכריזו ש"ההתנגדות לא תאכזב את האסירים ולא תתעלם מסבלם. נילחם למענם ונשרוף את כל מי שיתקרב אליהם או יאיים על חייהם". חבר הלשכה המדינית של החזית העממית בעזה, ג'מיל מזהר, אמר במסיבת עיתונאים מול מטה הצלב האדום ברצועה: "לא נשב בחיבוק ידיים. יש להמשיך את הפעולות ברצועת עזה ובגדה כדי להפריע לאויב הציוני. ההגנה על הגיבורים האלו מופקדת בידינו".