מסע לכידתם של ששת המחבלים שברחו מכלא גלבוע הוביל שורה של הגבלות מטעם שב"ס והמדינה כלפי האסירים הביטחוניים, במטרה לנסות ולמנוע מקרה דומה ובמטרה לדכא התפרעויות שהתפתחו בבתי הכלא.
הג'יהאד האסלאמי הודיע כי בתשובה למהלכים הישראלים הוא מקים ועד פעולה מיוחד. ב"מועדון האסיר" אישרו כי "האסירים של תנועת הג'יהאד האיסלאמי ממשיכים במאבקם נגד האמצעים הפוגעניים של הנהלת בתי הסוהר לכבוש, שכן הם הקימו ועדת חירום לאחר שהממשל ניסה לפרק את המבנה הארגוני שלהם".
בהצהרה שפרסמו נאמר כי "שבויי הג'יהאד האסלאמי החלו בשורת פעולות של אי ציות ומרידה בחוקי הכלא". האסירים נמנעו להתייצב בספירת הבוקר סירבו לצאת בזמן בדיקות ביטחוניות בתוך תאי הכלא וטענו כי כדי להוציא אותם מהתאים הסוהרים אוזקים אותם ומוציאים אותם בכפיה
בהצהרה הוסיפו כי "הנהלת בתי הכלא של הכיבוש, הטילה אמצעי ענישה על האסירים באופן כוללני, ואסירי הג'יהאד קיבלו עונשים כבדים יותר מאז שששת האסירים ברחו ממאסר בכלא גלבוע"
