הפעילות המבצעית שהתרחשה הלילה (א') ואליה נערכו בשבועות האחרונים, מוגדרת בצה"ל כייחודית ומורכבת כיוון שכללה פעולות מסתערבים ביחידות מובחרות ובהן יחידת דובדבן של חטיבת הקומנדו, וכן הוא נערך במקביל בשני אזורים, בנימין ומנשה.
יעד הפעולה היה תשתית גדולה של חמאס עם אמל"ח רב שנערכה להוציא פיגוע גדול. המטרה הייתה לסכל את החוליה לפני שהיא מוציאה את הפיגוע ולכן המבצע הוכוון לכל חברי החוליה באותו לילה.
במהלך הפעילות כוחות צה"ל הרגו חמישה מחבלים ופצעו עוד כמה אחדים, כשחלקם היו מטרות ללכידה וחלקם הגיעו עם פרוץ האש והירי לעבר הכוחות. בכפר בידו שבבנימין, שב"כ וימ"מ יחד עם חטיבת בנימין הגיעו למחבלים מטווח קרוב מאוד, שם המחבלים פתחו באש וחוסלו, ולכוחותינו לא היו נפגעים. כמו כן, נעצר המחבל המרכזי כוח של מסתערבים הוציאו אותו מתוך העיר ג'נין. במקרה הזה לא הייתה התנגדות אלימה.
האירוע בכפר בורקין הסמוך לג'נין היה קשה יותר. המחבל פתח באש לעבר כוח דובדבן, ושם התרחשה היתקלות מטווח קצר. באירוע הזה נפצעו הקצין, מפקד הפלוגה והקשר שלו.
צה"ל מתחקר את האירוע, ונכון לרגע זה נראה שהמפקדים פיקדו בשטח על האירוע וחתרו למגע עם המחבלים, כך שלא בכדי מי שנפצעו הם מפקד הפלוגה והקשר שלו.
בצה"ל מתארים סיטואציה של היתקלות בשטח מורכב בפאתי ביתו של המחבל, וייתכן שכחלק מחילופי האש בין המחבל לכוחות, הקצין והקשר נפגעו גם מהירי של כוחותינו. עד כה לא הובהר שמדובר בירי דו צדדי ואם אכן נפגעו הקצין והקשר מירי צה"ל מדובר בירי תועה. במקביל, כל הטענות של הפלסטינים לפיהם נורו יריות מרכב נוסע נשללו בתחקיר.
בצה"ל אומרים כי רבים מחברי החוליה נעצרו אולם לא בטוח שהתשתית סוכלה באופן סופי. המחבלים הוגדרו כפצצה מתקתקת ויתכן כי ביצוע הפיגוע נבלם אך לא נעצר באופן סופי. כמו כן, ייתכן כי לאחר החקירות יבוצעו מעצרים נוספים של שאר חברי החוליה.
מבצע מהסוג הזה הוא מורכב והכוחות לוקחים בחשבון כי יתכנו נפגעים, כיוון שכוח שנכנס למבצע כזה יודע מראש שהוא יתקל באש חיה ובמחבלים שיתנגדו באופן אקטיבי.
מבחינת איסוף הנשק, צה"ל שם ידו על מספר נשק בודדים בלבד. קשה להגדיר את המבצע כמוצלח ויתכן שיצטרכו בצה"ל להפיק לא מעט לקחים ממה שקרה אמש.