במוקד סערת הגיור נמצא ראש מערך הגיור, הרב משה ולר. במוצאי שבת בחצות יסתיים תפקידו בעקבות החלטת שר הדתות מתן כהנא שלא להאריך את כהונתו, בשל תפיסותיהם המנוגדות.
הרב ולר, שגזר על עצמו שתיקה בתקופה הסוערת סביבו, שוחח עם מקור ראשון והתבטא קצרות אך חריפות נגד מתווה הגיור שמקדם כהנא. "לא הגיוני שהולכים להעביר הצעת חוק שעוסקת בגיור בלי שמי שאחראי, הרב הראשי והרבנות הראשית, מעורבים בכך".
דברים אלו התווספו לאמירות קודמת שלו בוועדה לשירותי דת בדיון על שירותי מערך הגיור, אז התריע הרב ולר כי "אם תהיה תקלה בגיור, משהו שלא היה אלפי שנים, אנחנו פוגעים בעולם היהודי. כל נגיעה בגיור ושינוי – עלולים לשמוט את הקרקע תחת ידינו".
לאור זאת הבין השר כהנא כי הרב ולר לא יוכל להמשיך ולהגן על החוק אותו הוא מקדם והחליט להדיחו מהתפקיד, בו כיהן כממלא מקום שלוש שנים וחצי. הרב ולר יחזור לשמש כדיין, תפקיד בו כיהן בעבר.
ההחלטה לפטר את ראש מערך הגיור הובילה להכרזה של הרב הראשי דוד לאו להתייצב לצידו של איש אמונו, הרב ולר, ולהורות על עצירת כלל הגיורים. אלפי מתגיירים שעברו תהליך ארוך ומשמעותי אינם יכולים כעת להוציא תעודות גיור. שר התקשורת יועז הנדל וח"כים בקואליציה קראו לפיטוריו של הרב לאו, ובאופוזיציה מיהרו להביע בו תמיכה.
בצל אירועים אלו, הוחלט בקואליציה לתלות את ההצבעה על חוק הגיור בהצעת החוק שיקדם השר כהנא כחוק ממשלתי בתוך שבועיים. כהנא ישתמש בחוק שעומד לפני קידום בניסיון לשכנע את הרבנים המתנגדים לחוק שהצעתו עדיפה מזו של ח"כ מלינובסקי.
המחלוקת המרכזית בין הצדדים היא שאלת הפיקוח על הגיור תחת הרבנות הראשית, עליה מתעקש כהנא. אנחנו לא צריכים את הרבנות הראשית, אמרו שטרן ומלינובסקי, אם הם לא ירצו אנחנו נתקדם גם ככה. כהנא מעוניין למצות את המשא ומתן, אך לאור פיטורי הרב ולר ועמדת הרב הראשי הדבר אבוד מראש.
