חשש במשרד החוץ כי ההטיה הבינלאומית נגד ישראל תגדל משמעותית, על רקע ההאשמה השכיחה כי ישראל היא מדינת אפרטהייד. במשרד החוץ חוששים כי האשמה זו עלולה לצבור תאוצה, ושר החוץ יאיר לפיד, אמר היום (ב') בשיחה עם כתבים כי מדובר ב"שקר נאלח".
החשש הוא כי ההאשמה תשמע לא רק מפי ארגוני דה-לגיטימציה הפועלים כנגד ישראל, אלא גם מקרב גוף כלשהו השייך לאו"ם. ההטייה הקבועה כנגד ישראל, מתבטאת כעת בדיונים המתקיימים בכמה מוסדות של האו"ם. אחד המרכזיים שבהם נוגע להקמת ועדת החקירה למבצע "שומר חומות", בידי המועצה לזכויות האדם בג'נבה. המועצה שמגנה את ישראל באורח קבע מכל אחד מכינוסיה, הקימה וועדה בעלת מנדט רחב במיוחד ולא מוגדר בזמן, שפועלת לחיפוש הפרות של המשפט הבינלאומי במערכה שהתחוללה במאי האחרון.
הוועדה מתוקצבת ומאוישת באופן גבוה וחריג מוועדות אחרות של המועצה. כך, לשם השוואה, התקציב שלה הוא יותר מכפול ויש בה יותר תקנים, מאשר ועדת החקירה שהוקמה כדי לבחון הפרות של המשפט הבינלאומי בזמן מלחמת האזרחים בסוריה, שבמסגרתה נהרגו חצי מיליון בני אדם ו-11 מיליון איבדו את ביתם במלחמה שנמשכה 12 שנים. דו"ח ראשון של הוועדה אמור להתפרסם ביוני הקרוב, ועלול – אף שאין כמובן קשר ישיר בין הדברים, לטעון כי ישראל היא מדינת אפרטהייד.
בנוסף, בעוד שר הביטחון גנץ מקיים מפגשים ידידותיים עם אבו מאזן בביתו שבראש העין, ממשיכות פניות של הפלסטינים לגופים בינלאומיים, כדי לאיים על ישראל. כך, ב-2018 הגישו הפלסטינים במסגרת מנגנון התלונות הבין-מדינתי לוועדה הממונה על האמנה למניעת אפליה גזעית, תלונה נגד ישראל בה נטען כי ישראל מקיימת משטר אפרטהייד ומדיניות גזענית מפלה נגד הפלסטינים. במשרד החוץ קיימת הערכה כי הוועדה תפרסם דו"ח בנושא במהלך השנה הקרובה.
לצד זאת, בעוד מול ישראל תלויה ועומדת ההחלטה לפתוח בחקירה בבית הדין הפלילי הבינלאומי בהאג, נשקף גם איום מבית הדין הבינלאומי לצדק. הוא עלול להיענות לבקשה פלסטינית לחוות דעת מייעצת בשאלות על הגדרת מדיניות ישראלית כגזענות או כאפרטהייד.
ארגון "עד כאן" מסר בתגובה לדברים, כי הם "ממליצים לשר לפיד לקרוא את הפרסומים של ארגוני השמאל הקיצוני בישראל, כדי לגלות שארגוני דה לגיטימציה מהשמאל הקיצוני הם אלו שדוחפים את מדינות העולם וארגונים בינלאומיים להגדיר את ישראל כמדינת אפרטהייד. הגיע הזמן שהשר לפיד ינחה את אנשי משרדו ואת שאר משרדי הממשלה, לטפל באותם ארגונים מבית שפוגעים במדינת ישראל באמצעות הפצת שקרים ברחבי העולם".