נביל אבו רודינה, דוברו הרשמי של אבו מאזן, הגיב על ממצאי החקירה האמריקניים ואמר "אנו רואים בישראל אחראית מלאה להריגת העיתונאית שירין אבו-עאקלה, שנרצחה מאש הצבא הישראלי בג'נין ב-11 במאי". אבו רודיינה הוסיף בהצהרה הערב כי "לא נקבל בשום צורה תמיהות בקשר לתוצאות החקירה הפלסטינית, ונעקוב אחר הטיפול במקרה מותה של אבו-עאקלה בבתי משפט בינלאומיים, במיוחד בפני בית המשפט הפלילי. ישראל אחראית להריגתה והיא חייבת לשאת בתוצאות.
"אנו מביעים צער על כך שממשלת ישראל התחמקה מאחריותה כלפי רצח אבו-עאקלה, ואנו קוראים לממשל האמריקני לשמור על אמינותו ולהטיל אחריות מלאה על ישראל לרצח. העובדות שנחשפו בחקירה הפלסטיני והבינלאומיות מאשרות את אחריותו של הצבא הישראלי ללא כל ספק".
התביעה הכללית הפלסטינית הגיבה להודעה האמריקנית ואמרה כי היא מופתעת: "התחקירים המקצועיים שברשותנו מוכיחים שניתן להתאים את הקליע לנשק בו השתמשו בירי על שירין אבו-עאקלה. בנוסף מצלמות האבטחה ועדי הראייה שהיו במקום מוכיחים שהירי לעבר אבו-עאקלה היה מכוון".
בנוסף, בתגובה של התביעה הפלסטינית נאמר עוד כי היא הגוף שמוסמך לחקור את האירוע וכל מסקנות התחקירים שמבצעים גופים אחרים אינם מחייבים את הפלסטינים. "ישראל נושאת באחריות המלאה לחיסול ואנו נמשיך את ההליכים הנדרשים על מנת להביא את ישראל בפני בתי הדין הבינלאומיים", לשון ההודעה. בחמאס סירבו לקבל את תוצאות החקירה האמריקנית ואמרו שהיא מוטה לכיוון ישראל. הם קראו לבצע חקירה בין לאומית "מדובר בניסיון לזכות את הציונים מהשלכות הפשע המכוער הזה שזעזע את העולם".
ח"כ עאידה תומא-סלימאן מהרשימה המשותפת אמרה בתגובה כי "המומחים האמריקניים קבעו, בדיוק כמו מספר רב של תחקירים עצמאיים של הניו-יורק טיימס, הוושינגטון פוסט, ונציבות זכויות האדם של האו"ם, ששירין אבו-עאקלה נורתה, על פי כל הראיות, ע"י כוחות הכיבוש הישראלי. נמשיך להיאבק עד שהצדק ייצא לאור והאחראים להרג של שירין יועמדו לדין – מהחייל שלחץ על ההדק ועד הפוליטיקאים שאחראים על המדיניות ועל העלמת האמת".