המשטרה הימית של חמאס הורתה לדייגי רצועת עזה לעצור את ההברחות הימיות מכיוון מצרים. ייתכן שדווקא המצרים הם שלחצו על ארגון הטרור שיפסיק את פעולות ההברחה, שנגדן פועלת ישראל. המשטרה הימית ברצועת עזה פרסמה הודעה לדייגים, לפיה ההברחות ממצרים דרך הים היא עבירה על החוק והעובר עליה צפוי לעונש.
"אל תלכו שולל אחרי סוחרי נשק אפלים שטוענים כי הם מגובים על ידי ארגון או ממשלה וההברחה מאושרת על ידם", נאמר לדייגים, "מדובר בשקרים שאין להם בסיס".
צה"ל נלחם בתופעת הברחות הנשק והציוד לארגוני הטרור בכל הגזרות. במוצאי שבת האחרונה היו אלו לוחמי חיל הים שפעלו אל מול חופי רצועת עזה ומנעו משלוח שיועד לארגון חמאס. כלי שייט פלסטיני, שיצא ממצרים לכיוון רצועת עזה, חרג לשטח האסור לכניסה לדיג בדרום הרצועה, לוחמי חיל הים כרזו לעברו, וכשלא הגיב לקריאות ביצעו הלוחמים ירי בהתאם להוראות הפתיחה באש. המבריחים שהיו על הספינה קפצו לים ושחו לעבר החוף העזתי. על הסירה, שהוחרמה על ידי ישראל, נמצא ציוד שיועד לארגון הטרור חמאס.
חמאס מנצל את אישורי הדייג שמעניקה ישראל לדייגים ברצועת עזה, כדי לבצע הברחות ולאסוף מודיעין על ישראל. הוא רואה בנערי משפחות הדייגים, שחיים כל חייהם בים, ככוח העתידי של יחידות הקומנדו הימי של חמאס, המבצע תרגולים ומתחמש באמצעים יחודיים כדי לייצר מבצעים עתידיים נגד ישראל ולפתוח זירת עימות חדשה. בדומה לאירוע החדירה לחוף זיקים, שבמסגרתו חדרה חוליה של 4–5 צוללים מיחידת הקומנדו הימי של חמאס באמצעות הים, והגיעה לחוף זיקים ב-8 ביולי 2014, היום הראשון של מבצע צוק איתן.
הים משמש גם את הארגון לירי רקטות ניסיוניות ולבדיקה של אמצעים מפיתוח ויצור עצמאי של חמאס.