התבטאות חסרת תקדים של מזכ"ל מועצת הכנסיות העולמית, הכומר ג'רי פילאי המצדיקה את הפיגועים הרצחניים בירושלים בסוף השבוע מעוררת סערה. פילאי גינה תחילה את האלימות בבית הכנסת כמקום פולחן, וטען כי האלימות פוגעת בסיכויים בשלום ובצדק לכולם. לאחר מכן הוסיף פילאי כי ההתקפה על בית הכנסת בירושלים התרחשה כתגובה לפשיטה צבאית ישראלית בה נהרגו תשעה בני אדם, כולל אישה זקנה, בעיר ג'נין שבגדה המערבית. הוא הוסיף ואמר כי הפיגוע הנוסף שבוצע על ידי ילד בן 14 בעיר דוד, התרחש לדבריו "בהתנחלות בשכונת סילוואן במזרח ירושלים הכבושה, ממנו נפצעו שני מתנחלים ישראלים".
המזכ"ל טען כי יש "לגנות בחריפות את ההתקפות חסרות ההבחנה של הצבא הישראלי על האוכלוסייה האזרחית בג'נין וללא סוף לכיבוש, מעגל האלימות יימשך". הוא סיים את דבריו עם נתונים על האלימות בגדה המערבית, לדבריו, וציין כי "השנה החולפת הייתה הקטלנית ביותר הן עבור הפלסטינים בגדה המערבית והן עבור ישראלים זה כמעט שני עשורים. בינואר 2023 יותר מ-40 בני אדם נהרגו וביניהם 8 ילדים".
נשיא ועידת רבני אירופה ולשעבר הרב הראשי במוסקבה, הרב פנחס גולדשמידט אמר בתגובה כי זו "אמירה מבישה ומסוכנת של מזכ"ל הכנסיות העולמית המתירה את דמם של יהודים בישראל וברחבי העולם בחסות טענות הכיבוש. כל עוד הכנסייה הרוסית האורתודוקסית חברה במועצת הכנסיות העולמית, אין להם שום זכות מוסרית להרצות בפני ממשלות בנושאי מוסר".