12 שעות אחרי היתקלות בג'נין ולאחר תחקיר מעמיק של אוגדת איו"ש ההערכה בצה״ל היא כי המטען שהופעל הבוקר יוצר בתוצרת מקומית והופעל ככל הנראה מרחוק. מסוק הקרב שהשתתף במבצע וירה טיל לשטח פתוח, נחת לאחר המבצע וגילה כי נפגע מקליעים של החמושים. הנזק נבחן כעת אולם לא סיכן את הטייסים. למרות הפגיעות המסוק המשיך להשתתף במבצע.
המבצע כאמור הסתיים אחרי 12 שעות בגלל חילוץ כלי הרכב שנפגעו מהמטען ומהירי הרב שספג וכעת פועלים לתחקר את האירוע ואת הפער המודיעיני ומעריכים כי יהיו נסיונות להגיב למותם של חמישה פלסטינים. בשלב הזה אין כוונה לתגבר כוחות אולם בימים הקרובים יתקיימו כמה הערכות מצב לבחון את הנושא.
בצה"ל לא ממהרים להכריז על מבצע צבאי בעקבות ההסלמה בפעולות המעצרים. אולם לצד זה ברור לכולם שאירוע אחד חריג ויש היתכנות שהמבצע זו רק שאלה של זמן. למרות האירוע הבוקר ההבנה היא כי יש פער שצריך לסגור אותו בכל הקשור למודיעין שלא היה למערכת על מטען כזה גדול, על הייצור שלו, ההסתרה שלו והפעלתו מרחוק.
בנוסף מבהירים גורמים בצה"ל כי הרכבים הממוגנים הפועלים מבצעית ביהודה ושומרון ממוגנים ביחס לתרחיש הייחוס. הם מוגנים מפני ירי נשק קל, ירי מקלעים, מטעני צינור ובקבוקי תבערה אולם מטען רב עוצמה דורש מיגון אחר. בנושא מיגון הגחון אומרים בצה"ל כי הנושא מוכר ונמצא בטיפול אולם ייקח קצת זמן עד שכלי הרכב יקבלו את המיגון הדרוש.
גורם צבאי סיפר הערב כי "לאורך כל הפעילות כלל הכוחות חתרו למגע ופעלו בנחישות לסיכול האיומים. כמו כן, מסוקי סער הוזנקו לחילוץ נפגעים וחילצו לוחמים מהשטח. מסוקי קרב הוזנקו לאירוע והפעילו אש לסיוע הכוחות בשטח".
כאמור במהלך הפעילות נפצעו שבעה לוחמים באורח קל ובינוני, לוחם נוסף פונה באורח קל לטיפול רפואי בבית חולים לאחר שנפצע מרסיסים, משפחתו עודכנה.