לאחר חמישה ימים של פעולה מבצעית סביב בית החולים שיפא צה״ל מצא בתוך בית החולים, באחת הסככות בחלקו הצפוני, את אחד הרכבים ששימש את המחבלים בשבעה באוקטובר.
מדובר בטנדר טויוטה שהיה מאובזר וערוך ליציאה בדיוק כמו הרכבים שהשתתפו בטבח בעוטף. מתחת לטויוטה נמצא פיר מנהרה ובתוכו ספירלה של מדרגות שהובילו לתוך מנהרת טרור מתחת לשיפא. המדרגות ירדו לעומק של עשרה מטרים והובילו לחלל אחד שהיה סגור עם דלת הדף ופתח לירי. צה״ל תחקר את מנהל בית החולים שהכחיש את הידיעה כי במקום ישנה מנהרה. בנוסף נמצא חדר פיקוד ושליטה שממנו בכירי חמאס ניהלו את הכוחות בשטח. בנוסף נמצאו ציודי לחימה, נשקים, רימונים, מטענים, ווסטים ומחשבים עם חומר מודיעיני. הערכה בצה״ל היא כי חמאס הסליקו הרבה מאוד אמל״ח והצליחו להבריח את המחבלים מבית החולים.
במסגרת המבצע דובר צה״ל מתיר לפרסום תיעוד מיוחד איך צה"ל ושב"כ חשפו מנהרת טרור מתחת לבית החולים שיפאא׳. על המבצע אמונים כוחות צה״ל בפיקוד אוגדה 36 ובהשתתפות כוחות מיוחדים מיחידות שלדג, יהל״ם ועוקץ, חשפו בהכוונת שב"כ ואמ"ן, תוואי מנהרת טרור באורך של כ-55 מטרים ובעומק של כ-10 מטרים מתחת לבית החולים שיפאא׳.
פיר המנהרה, אשר גרם מדרגות עמוק מוביל לפתחו, מכיל אמצעי הגנה שונים לרבות דלת הדף וחרך ירי. דלת מסוג זה משמשת את ארגון הטרור חמאס לחסימת יכולת הכניסה של כוחותינו למפקדות ונכסי תת הקרקע של הארגון. פיר המנהרה אותר בשטח בית החולים מתחת לסככה, בה היה גם רכב ועליו אמצעי לחימה רבים הכוללים RPG, מטענים, נשקי קלצ’ניקוב ועוד.
כוחות צה״ל ושב"כ ממשיכים בפעילות לחשיפת תוואי המנהרה.
