בעקבות הדיווח כי חיילים מגדוד "נצח יהודה" שקראו "שמע ישראל" בזמן פעילות מבצעית בג'נין הושעו מפעילות, פנה יו"ר ועדת החוץ והביטחון ח"כ יולי אדלשטיין לרמטכ"ל הרצי הלוי וקרא לו לשקול שנית את ההנחיה.
אדלשטיין כתב: "קראתי בדאגה את הודעתו של דובר צה"ל בנוגע להרחקתם מפעילות של לוחמי צה"ל לאחר שקראו 'שמע ישראל' במסגד בג'נין. מבלי לגרוע משיקול הדעת המוטעה של החיילים, סבורני כי ניתן לנהל את הטיפול בצורה מתונה יותר מאשר הרחקה מפעילות. מוטב היה לו מפקד בכיר היה עורך להם שיחה ומחדד את הנהלים". לדבריו, במערך השיקולים, יש לכלול גם את נושא המוטיבציה והמוראל בקרב חיילנו, "שעושים לילות כימים ומחרפים את נפשם בלחימה עזה בקיני הטרור הללו. אני קורא לך לשקול מחדש את דרך הטיפול בהם".
גם השר לביטחון לאומי בן גביר יצא נגד דרך הטיפול בחיילים. "אין מקום לדין משמעתי נגד לוחמים שמוסרים נפשם למען עם ישראל בלב התופת בג'נין, וכל חטאם הוא אמירת שמע ישראל במקום שהפך לאחד ממוקדי הטרור המרכזיים נגד ישראל", טען בן גביר. ואמר צריך להעניק ללוחמים גיבוי מלא ו"לא להתעסק בדין משמעתי בעניינים שאינם אמורים להעסיק את צה"ל בודאי לא בזמן מלחמה".
חברי הכנסת מהמפלגות הערביות התרעמו על השמעת שירי החנוכה וקריאת שמע ישראל במסגד. "לא קל לנו כמוסלמים להתמודד עם תוצאות המלחמה הקשה והתמונות הכואבות מרצועת עזה, להוסיף לזה התגרות במימד יחסי דת האיסלאם ויהדות, שלאורך 1,400 שנים ידעו לכבד אחת את השניה זה יותר מדי טיפשי וראוי לגינוי", צייץ יו"ר רע"מ מנסור עבאס. "בג'נין חיילים שמו שירי חנוכה במיקרופון של המסגד", זעק ח"כ אחמד טיבי. "איזה ביטחון זה מעניק לכם? ההפך, אתם יודעים מה עשו תושבי ג'נין בתגובה? זה מה שאתם רוצים? טיפשות. ככה לנסות להשפיל? לשים להם שירי חנוכה? זה חושך"
חברת הכנסת מיכל וולדיגר הגיבה לדבריו עם תמונה מהפיגוע בבית הכנסת בהר נוף, שבו נרצח מתפלל כשהוא עטור בתפילין וטלית. "להלן 1,400 שנה של כבוד בין הדתות. מנסור אני לא קונה את זה, עם ישראל לא קונה את זה".