במקביל להליך הבדיקה שמבצע מבקר המדינה על אירועי השבעה באוקטובר, גם בצה"ל ממשיכים לתחקר את מתקפת הטרור על יישובי העוטף והודיעו כי במסגרת תהליך תחקור אירועי השבעה באוקטובר בפיקוד הדרום, כחלק מתהליך התחקירים והלמידה המבצעית המטכ"לי, מונו מפקדים לתחקור הקרבות ביישובי הדרום.
המפקדים אחראים על תהליך התחקיר ביישוב על כלל היבטיו, תוך שימת דגש לשיח עם התושבים ואיסוף כלל תיעוד מימי הלחימה. רשימת הקצינים שמונו לתחקר את הקרבות ביישובי הדרום בשבעה באוקטובר: אלוף במיל' מיקי אדלשטיין שיהיה אחראי על תחקור הקרבות בבארי, כולל אירוע בני הערובה וההחלטות של תא"ל ברק חירם.
את קיבוץ זיקים והחוף יתחקר מח"ט 5, אל"ם טל קוריצקי. את קיבוץ נחל נחל עוז יתחקר אל"ם (מיל') ירון סיטבון. את קיבוץ כיסופים והמוצב הסמוך יתחקר מח"ט 14, אל"ם טל אלקובי. את תחקיר הקרב בכפר עזה ירכז מח"ט 55, אל"ם עודד זימן. את הקרב במוצב נחל עוז יתחקר מח"ט 551, אל"ם עידו קס. את תחקיר מוצב פגה יתחקר אל"ם (מיל') נועם בן ארי. את הקרבות במחנה רעים יתחקר סמאו"ג 143, אל"ם אלי טולדנו.
בנוסף, את מעבר ארז ומפקדת התיאום והקישור יתחקר מפק"ץ פו"מ אלון, אל"ם גידי כפיר אל, כשאת הקרבות בדרום העוטף, ישע, יתד, חולית, מבטחים, כרם שלום, מגן, מוצב אמיתי, ניר יצחק, סופה, פריגן ושלומית, יתחקר צוות בהובלת מפקד עוצבת אדום, תא"ל איתמר בן חיים.
את הקרב בעין השלושה יתחקר מפקד פו"מ אלון, אל"ם זיו נמני. את אירועי נירים יתחקר מח"ט 646, אל"ם אלעד שושן. את הקרב הקשה בקיבוץ ניר עוז יתחקר מח"ט 454, אל"ם יותם ברנשטיין. מח"ט 12, אל"ם עברי אלבז יתחקר את אירועי נתיב העשרה. את אירועי נתיבות ויכיני יתחקר מפק"ץ פו"מ אפק, סא"ל צפריר הר שושנים.
את הקרב בקיבוץ עלומים יתחקר קצין אג"ם מפע"ם, אל"ם עידו סעד. את הקרבות בצומת שער הנגב וחץ שחור יתחקר מפקד המכללה לפיקוד טקטי אל"ם אריק מויאל. את הקרבות ברעים, צומת רעים וצומת גמה יתחקר מפק"ץ פו"מ, אל"ם יגאל דדון, את הקרבות שאירעו בשדרות יתחקר מח"ט ירושלים אל"ם ניתאי עוקשי.
את תחקירי גזרת יפתח וצומת יד מרדכי יוביל מפק"צ במלט"ק, סא"ל מאור צדקה. את תחקירי גזרת כיסופים ירכז מפק"צ במלט"ק, סא"ל נוף בראון. את תחקירי גזרת כרם שלום יוביל מפק"צ במלט"ק, סא"ל פז גדיה ואת תחקירי גזרת נחל עוז ירכז מפק"צ במלט"ק, סא"ל יוני דהן.
פעילות כוחות צה"ל תחת פיקוד משטרת ישראל באופקים מתוחקרת ע"י ידי מח"ט 261, אל"ם יהודה ואך. הקרב באורים מתוחקר על ידי פיקוד העורף בסנכרון עם אוגדת עזה, כשתהליך התחקור עתיד להסתיים במהלך חודש יוני, בהתאם לתמונת המצב המבצעית.
