במסגרת מבצע שהתרחש הלילה (ג') בטול כרם, בהשתתפות כוחות מיחידת דובדבן, סיירת חרוב, מג"ב ושב"כ, חוסלו מספר מחבלים, בהם מפקדי חמאס וגדודי חללי אל אקצא בעיר. על פי דיווחים בסוכנות ידיעות פלסטינית, שני מחבלים הנחשבים לבכירים חוסלו בתקיפת כטב"ם בטולכרם – מפקד הזרוע הצבאית של חמאס (גדודי עז א-דין אל-קסאם) בעיר, אשרף נאפע, ומפקד הזרוע הצבאית של פתח (גדודי חללי אל-אקצא), מוחמד אבו עבדו.
בצה"ל מבהירים שהמבצע אינו תגובה לרצף הפיגועים שנעשו לאחרונה נגד ישראלים וחיילי צה"ל, אלא חלק מתהליך מבצעי ארוך נגד ארגוני הטרור ביהודה ושומרון. במשך השנים האחרונות צה"ל נמנע מכניסה למחנות הפליטים באזור, אך עם תחילת המלחמה הוחלט "לכסח את הדשא" ולמנוע מארגוני הטרור ביו"ש לעורר זירה נוספת, וכך התבצעו עשרות מבצעים גדודיים וחטיבתיים במחנות הפליטים, בעיקר במרכזיים שבהם – נור א-שמס, טול כרם וג'נין. כיום המצב בהם שונה משמעותית ממה שהיה ערב ה-7 באוקטובר. מתחילת המלחמה חוסלו בגזרת מנשה 270 מחבלים, ובכל יהודה ושומרון חוסלו 450 מחבלים.
במבצע האחרון, נקט כוחות צה"ל בטקטיקת הטעיה: הכוחות החלו לפעול בנקודה מסוימת בעיר נגד תשתיות הטרור והמעבדות להכנת מטענים. הבכירים הניחו שצה"ל פועל רק באותו אזור והתמקמו בצד אחר של טול כרם. עם הגעתם לאותו מרחב – הם חוסלו על ידי כטב"ם. בצה"ל מציינים שהדיווחים על אישה פלסטינית שחוסלה במבצע הם נכונים, אך לא מדובר בעוברת אורח חפה מפשע, אלא במחבלת שאחזה בנשק והתחפשה לפראמדיקית.
בנוסף, מזהים בצה"ל בתקופה האחרונה ניסיונות לחזק את הקשר בין עזה ליהודה ושומרון, שמתבטא בהכוונה של חמאס והג'יהאד האיסלאמי, הזרמת כספים, העברת ידע לבניית מטענים ותכנון פיגועים וכן לחץ גלוי וסמוי כדי שיבעירו את השטח. בצה"ל פועלים לסכל גם את הקשר הזה.
