90 מחבלים הכלואים בישראל צפויים להשתחרר בשעות הערב במסגרת השלב הראשון לשחרור חטופים, תמורת שלוש החטופות – רומי גונן, אמילי דמארי ודורון שטיינברכר. עשרות מהמחבלים ישתחררו ישירות לבתיהם ביהודה ושומרון, ואף למזרח ירושלים. בפיקוד מרכז מדגישים כי הם נערכים לכך בהגנה ובהתקפה כשישנו חשש גדול מפיגוע השראה במודל פונדוק.
בפיקוד מרכז אומרים כי ההערכות הן שחמאס ינסה להוציא פיגוע תוך כדי הפסקת האש ביו"ש ולכן צריך להיות חדים בהגנה. ייעשו "ביקורי בית" למחבלים, ולא מעט לקחים ילמדו מטעויות העבר. על חזרתם של המחבלים לבתי מגוריהם, הגם שסמוכים לבתי קורבנותיהם היהודים, אומרים בצבא כי ילמדו את ההגבלות שיש על המחבלים בהסכם ויוסיפו הגבלות נוספות אם צריך. בכל מקרה, במערכת הביטחון מדגישים כי כל המחבלים מתודרכים על ידי גורמי השב"כ, ומבינים את ההשלכה של חזרה לטרור.
לקחים רבים נאספו ונלמדו בעקבות עסקת שליט ב-2011 והעסקה הראשונה להחזרת חטופים בדצמבר 2023, מהם עולה כי רבים מהם חוזרים לעסוק בטרור או לעודד פיגועים. מתוך כ-150 ששוחררו בעסקה הקודמת ליו"ש, כ-30 מחבלים נעצרו שוב על ידי מערכת הביטחון, ועוד שלושה חוסלו בתקריות שונות על ידי צה"ל.
הדגש של פיקוד מרכז בהגנה מתקיים במספר רבדים: שבע פלוגות הגיעו הבוקר לגזרת יהודה ושומרון וחולקו בין החטיבות המרחביות השונות, גיוס ההגמ"רים ביישובים הוארך עד לסוף חודש פברואר וייתכן שאף ליותר מכך בשל חודש הרמדאן שיחול באותם ימים. בנוסף, בצה"ל הקימו נקזים ומחסומים במעבר בין צירים פלסטינים לכבישים משותפים עם יהודים ומתאמים את הפעילות מול מנגנוני הרשות שחוששים מהתחזקות חמאס בשטח.

בפן ההתקפתי, בפיקוד מרכז מתכננים פעילות סיכול אינטנסיבית במוקדי הטרור של יו"ש, כשגדודי לוחמים ויחידות מיוחדות צפויים להגיע לאזור בקרוב – מיחידת אגוז, גדוד נחשון ומפקדת חטיבת הקומנדו שתסייע בתכנון, שיצטרפו לסיירת חרוב, יחידת דובדבן וימ"ס איו"ש שכבר פועלים במרחב.
אחד הדגשים הוא מול חגיגות השחרור הצפויות בכפרים. רכזי שב"כ נכנסו למוקדים ולמשפחות המחבלים שישוחררו והדגישו מולם שאין לעשות זאת כדי שלא יביא להשראה ועידוד לפיגועים. בצה"ל הדגישו שלא יהססו להגיב ולעצור חגיגות ותהלוכות, וזאת ההגדרה שמפקד האוגדה והמח"טים קיבלו.
המחבלים שישוחררו מבתי הכלא הישראלים יעלו על אוטובוסים, ויוסעו למעבר ביתוניא, שם נוצר מרחב סטרילי אליו יגיעו האוטובוסים. משם המחבלים יועברו לצלב האדום ולרשות הפלסטינית ויגיעו לבתיהם.