הרחפן הולך ומשתלב בקצב מהיר בכל חלקי הצבא, שלומד לנצל היטב את היכולת הזמינה שהוא מציע, שהפכה לנפוצה כל כך בשנים האחרונות. בין היתר עורבו רחפנים בפעילות הביטחון השוטף ביהודה ושומרון, בדגש על הגנת גדר המערכת לאורך הקו הירוק. הרחפנים מהווים גורם משמעותי בהגברת התפיסות של שב"חים המנסים לחדור לשטח ישראל לאורך הגדר; כך למשל בגזרת אפרים, סביב מעבר אייל, עלו מספר התפיסות והמעצרים של שב"חים המנסים לחצות את הגדר בחודשים האחרונים בלא פחות מ-90 אחוז. בהתאם למספר המעצרים, מספר השב"חים המצליחים לחדור ירד משמעותית. את המגמה ניתן לראות לכל אורך הגדר.
גורם נוסף שתרם לירידה בכמות החדירות לשטח ישראל הוא ההחלטה להעלות את מספר היתרי העבודה לפועלים פלסטינים – צעד שנעשה מלכתחילה במטרה למנוע חדירה לא חוקית ושהייה אסורה בישראל. כמו כן, בדומה לגבול עזה ולגבול הצפון, גם בכל תוואי התפר ביהודה ושומרון משרתות תצפיתניות, שפועלות באמצעות רשת של מצלמות לכל אורך הגדר, ותרומתן לסיכול החדירות גבוהה ביותר.
כל מג"ד באיו"ש מחזיק בחפ"ק רחפן שנמצא לצדו תמיד. הרחפן משמש עזר משמעותי, כאמור, באבטחת קו התפר. "לא מזמן היה לנו כאן חשוד שחיבל בגדר", מספר סא"ל שרון איטח, מג"ד "קדם" בפיקוד העורף, שהגדוד בפיקודו סיים אתמול תעסוקה מבצעית בגזרת אפרים. "ראינו אותו מנסה לחתוך את מעבר המים מתחת לגדר ההפרדה כדי לעבור בפנים. תוך כדי שהוא חתך עם הדיסק הגענו מעליו עם רחפן ותיעדנו, הוא אפילו לא שמע בגלל רעש החיתוך שעשה הדיסק שאיתו הוא עבד. תוך כמה דקות הוא נעצר – ויש לנו ביד הפללה: תיעוד של השחתת הגדר".
הרחפן הוא עזר חשוב גם במקרים של צורך בסריקה מידית של שטח רחב – והוא אכן רואה שימוש במקרים כאלו. במהלך השיחה עם סא"ל איטח מתקבלת התראה מעמדת השמירה בקרני שומרון על אדם חשוד – איטח סורק בקצרה את השטח ואז שולף את הרחפן ומעלה אותו לאוויר, מה שמאפשר לו בתוך זמן קצר לסרוק מלמעלה תוואי שטח רחב ולוודא שהוא נקי מסכנות.
ביחידות הלוחמות כיום בצה"ל, כל מפקד פלוגה מחזיק בכל רגע נתון בשני רחפנים שמעניקים סיוע חשוב מאד בפעילויות. מי שהוכשרו להפעלת הרחפנים הם לוחמים מהפלוגות, שהועברו להשתלמות קצרה ובסיומה חזרו ליחידתם המקורית כמפעילי הרחפנים. הפלוגות המחזיקות ברחפנים הן כל פלוגת חי"ר, קומנדו, ובט"ש.
שימושים מבצעיים נוספים לרחפנים שמתפקדים כבר כיום בצה"ל הם רחפנים המטילים רימוני גז מדמיע על מפגינים ומפרי סדר – אמצעי המשמש רבות את הכוחות בגבול עזה, ואמצעי נוסף שכבר נכנס חלקית לשימוש הוא רחפן שמעביר ציוד רפואי לשטח בעת הצורך.
