"חיילים נהרגים כי הם לא שומרים מצוות"
עוד התבטאות מעוררת סערה של הרב עובדיה: 'פלא שחיילים נהרגים במלחמה? אם הם לא שומרים שבת, לא מתפללים, לא מניחים תפילין', אמר בדרשת מוצ"ש
הרב עובדיה הסביר כי בעבר הרחוק - הרחוק מאוד - כללי הגיוס הנוקשים קבעו כי אנשים שעברו עבירות, אפילו כאלה שנחשבות לא חמורות, לא יצאו למלחמה, בגלל החשש שלהם שבשל העבירות שעשו ייענשו וימותו בקרב.
הרב הדגיש כי לפני היציאה למלחמה היו מודיעים למגויסים: "מי שירא ורך הלבב יילך וישוב לביתו", זאת בהתאם לפסוק המקראי: "מי האיש הירא ורך הלבב - יילך וישוב לביתו ולא ימס את לבב אחיו כלבבו".
הרב עובדיה הבהיר לאיזה לוחמים הכוונה על פי המפרשים: "מי זה 'ירא ורך הלבב'? זה אדם שיש לו עבירה. פוחד אולי חס ושלום בשביל אותה עבירה ימות במלחמה".

לדבריו, באותם ימים כל החיילים שיצאו למלחמה "היו צדיקים, היו קדושים", ובשביל לצאת למלחמה צריך היה "להיות נקי וזך". האחרים שלא היו צדיקים מספיק "היו עוזבים את הצבא. היום ייעשה דבר כזה? המפקד יכניס אותו למחבוש. מה זה יילך הביתה? מה זה צריך להיות?".
עוד הוסיף הרב: "אבל אז היו צדיקים, היו קדושים כל החיילים... תארו לכם מה היה צריך להיות כל חייל וחייל - לא רק שהוא מתפלל,
לאחר מכן התייחס הרב עובדיה לחיילים שאינם שומרים מצוות והסביר כי לא פלא שהם נהרגים: "אז זה פלא אם חס ושלום נהרגים חיילים במלחמה? שהם לא שומרים שבת, לא שומרים תורה, לא מתפללים בכל יום, לא מניחים תפילין בכל יום? זה פלא שהם לא נהרגים? לא פלא".
עם זאת, הרב עובדיה, שמתמיד לדבר על חיילי צה"ל כשהוא מזכיר אותם בדרשותיו בדאגה ובחיבה רבה, בירך גם הפעם את החיילים בחום רב ואיחל להם שיחזרו בתשובה, שישובו בשלום ושיתגברו על אויביהם וימחצו אותם: "ה' ירחם עלינו, יחזיר אותם בתשובה שלמה, כולם יילכו שמה לחיים טובים ולשלום, יתגברו על אויביהם".
הוא הוסיף ואיחל לחיילים שבמלחמתם מול אויבי ישראל יתקיימו עבורם הפסוקים: "'ארדוף אויביי ואשיגם, אמחצם ולא יוכלו קום, ייפלו תחת רגלי. אמן".
הרב הרפורמי גלעד קריב אמר בתגובה: "חבל שגאוניותו של הרב עובדיה לא עמדה לו בזמן מלחמת לבנון וכך, במקום לשלוח את תלמידיו הצדיקים לשדות הקרב, הותיר אותם בישיבה והפקיר בכך את חייהם של כל חיילי צה"ל 'החוטאים'".
עוד אמר קריב: "כל תפילותיו של הרב עובדיה בחודש אלול, וכל תקיעות השופר בביתו לא תעזורנה לו לכפר על התבטאותו האיומה. מן הראוי שסיעת ש"ס הצייתנית תשכור השנה מסוק ותטיס את הרב לא לעצרות התעוררות, כי אם לביתם של כל המשפחות השכולות על מנת לבקש את סליחתן".