תיק ליברמן: חקירה בת יותר מעשר שנים
מאז התיק הראשון ב-2001 ועד הודעת היועמ"ש אמש התנהלה חקירת שר החוץ על ידי יאח"ה. כל הפרטים על החקירה שליברמן ניסה למנוע

כתב האישום עתיד לכלול עבירות של מרמה והפרת אמונים, קבלת דבר במרמה בנסיבות מחמירות, הלבנת הון והטרדת עד, וזאת בכפוף לשימוע שייערך לו. סעיף השוחד שיוחס לו במהלך החקירה לא יוכנס לכתב האישום.
החקירה המשטרתית נגד ליברמן החלה בשנת 2001. בתיק הפלילי שנפתח נגדו, תיק מספר 18/01, נבדק החשד הראשוני לפיו השר עבר על חוק מימון הבחירות.
במאי 2005 מסתיים תיק פלילי 18/01 עם העברת החומר על ידי המשטרה לפרקליטות. נציגי הפרקליטות שעיינו בתיק החליטו כי לא נמצאה תשתית ראייתית מספקת להעמדתו של ליברמן לדין והם מודיעים על כך למשטרה.
חצי שנה לאחר מכן, בנובמבר 2005 - העביר מבקר המדינה למשטרה מסמכים חדשים הנוגעים לחשבונות בנק שהתגלו באקראי על ידי גורם פוליטי והועברו אליו. המשטרה החל בבדיקת החומר אך טרם פותחת בחקירה.
באפריל 2006, מנחה היועץ המשפטי דאז, מני מזוז, את המשטרה לפתוח מחדש את החקירה בעניינו של ליברמן. במאי אותה השנה, יומיים לאחר הוראת היועץ המשפטי, המשטרה פותחת תיק חקירה חדש שמספרו 55-06 נגד אביגדור ליברמן. בשלב ראשון מדובר בחקירה סמויה ובראשה עומד נצ"מ ערן קמין.
שנה לאחר מכן, באפריל 2007, החקירה הופכת גלויה עם פשיטת המשטרה על משרדו של עו"ד יואב מני. המשטרה מוצאת במקום אלפי מסמכים ולוקחת אותם להמשך חקירה. במקביל השר ליברמן המכהן כסגן ראש הממשלה מזומן לחקירה תחת אזהרה וראש צוות החקירה נצ"מ ערן קמין מקריא לו את החשדות נגדו: שוחד, הלבנת הון ושיבוש הליכי חקירה.
ימים
בדצמבר 2007, נעתרת שופטת בית משפט השלום בתל אביב, רחל גרינברג, לבקשת המשטרה וקובעת כי לא חל חיסיון על המסמכים. "מעיון בנספח הסודי שהוגש לבית המשפט", כתבה בהחלטתה, "עולה כי קיים חשד ממשי שחלק מהמסמכים הנם כוזבים או מטעים ומכוונים להסוות פעילות החשודה כפלילית".
השופטת הוסיפה: "קיים חשד כי עו"ד מני היה מעורב בסיוע או קידום המעשים בפליליים בהם נחשד ליברמן, קובעת השופטת".
בעקבות ההחלטה, מגיש פרקליטו של ליברמן, עו"ד מני, ערעור לבית המשפט המחוזי. במרץ 2008, נדחה ערעורו ובית המשפט המחוזי מותיר את החלטת השופטת גרינברג על כנה. השופט, שמואל ברוך, שנפטר מאז, כתב: "התמונה המצטיירת היא תמונה מדאיגה ומצביעה על מעורבות לכאורית של ליברמן, בתו ואני חייב לומר בצער, גם של עו"ד מני במעשים שדבק בהם יותר מאשר גוון פלילי".

החקירה בפרשה מתרחבת בינואר 2009. במבצע נרחב של המשטרה נעצר עו"ד מני, וגם המנהל האסטרטגי של מפלגת ישראל ביתנו, שרון שלום. השופט בני שגיא מורה על הארכת מעצרם של חלק מן החשודים. באותה שנה, בין החודשים אפריל ומאי, נחקר השר אביגדור ליברמן חמש פעמים תחת אזהרה במשרדי יאח"ה בלוד כשהחוקרים מאמתים אותו עם מרבית חומר החקירה שנאסף נגדו והוא נדרש לתת הסברים.
במקביל מעוכב לחקירה שגריר ישראל בבלרוס, זאב בן ארי, בחשד כי שיבש את חקירת ליברמן וחשף בפניו במהלך ביקורו מסמך סודי הקשור לחקירת המשטרה בבלרוס. השגריר מודה בחלק מן החשדות נגדו ומשוחרר בתנאים מגבילים.
באוגוסט 2009 מודיעה יאח"ה על סיום החקירה בעניינו של ליברמן בתיק 55-06 ועל העברת התיק לפרקליטות עם המלצה להגיש נגדו כתב אישום בשורה של עברות שהמרכזיות שבהם קבלת שוחד והלבנת הון.