עבור הווצרות חלבון חדש שנניח מחבר שתי מולקולות(דנ'א ליגאז למשל) יש צורך בהווצרות 3 אתרים:2 אתרים הנקשרים לשתי המולקולות ואתר המבצע את הריאקציה.אתר מינימלי חייב להיות מורכב מ30-50 ח'א(בכדי להיות יציב וליצור אתר פעיל)ולכן בכדי ליצור חלבון חדש ממוצע, יש צורך באיזה 100 חומצות אמינו בסדר ספציפי,בין אם בהצטברות ניטרלית או לא,מדובר במרחב צירופים של 100^20 וגם טרליון שנה של מוטציות על כל כוכבי היקום לא יספיקו לכסות טרליונית של האפשרויות.ומשל המטבעות אינו תופס כאן כי לא כל רצף בא בחשבון.גם ,כאמור,לא ניתן להתחיל מחלבון פשוט יותר,כי יחסרו האתרים הכרחיים לפונקציה.
מכאן נראה שהאבולוציה חסרת סיכוי.ונא לא לשלוח אותי לקריאת ספרי מדע פופולארי.עיינתי גם בספרים המקצועיים ואין לכך תשובה.זו אחת הבעיות הגדולות כיום בביולוגיה ואבולוציה.ולמעשה,זה אכן נראה חסר סיכוי.לכן קיימת התנגדות לאבולוציה גם באקדמיה.
נמצאו גם סתירות בעצים פילוגנטים.למשל חלבון מסוג היסטון h4 ,הנחשב לשמור,נמצא שונה מאוד במינים קרובים וזהה במינים רחוקים.