הסטודנטים לא בוחרים את יו''ר האגודה, אלא הם בוחרים את 75 חברי מועצת האגודה, והם אלה שבוחרים את היו''ר ואת שאר חברי הוועד. הבחירות למועצה מתקיימות פעם בשנה, בסוף דצמבר-תחילת ינואר. שבועיים אח''כ המועצה מתכנסת, וחבריה הם אלה שבוחרים את היו''ר ואת שאר חברי הוועד. כשיו''ר עוזב באמצע קדנציה של מועצה, כמו שקרה השנה עם גיל גולדנברג, המועצה בוחרת יו''ר חדש עד לכמה חודשים, עד הבחירות שיהיו בסוף דצמבר.